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2019年12月底，誰料得到出現不明原因的肺炎疫情。
疾控中心的直報系統對不明原因肺炎的監測、報告很嚴謹。可是，隨著武漢肺炎疫情加劇，媒體開始關注疾控中心的直報系統是否失靈？《經濟觀察網》曾於2020年2月3日刊登「SARS之後國家重金打造的傳染病網路直報系統，為何並未及時啟動」，結語提到：“在12月31日，國家衛健委專家組到達武漢以後，至1月20日疫情緊急升級的這20天裡，究竟發生了什麼事？國家衛健委專家對疫情給出了怎樣的研判？又給出了如何防止控制疫情？<ref name="Wuhan-2111">[https://www.epochtimes.com/b5/20/2/12/n11863890.htm 武漢P4實驗室陷新冠病毒風暴眼的背後 ]</ref>
==='''爭議二：2019新型冠狀病毒哪裡來？'''===
2019年12月31日，中國湖北省武漢市發現若干例肺炎病例。該病毒與任何其它已知病毒不符。
2020年1月7日，中國主管部門確認他們發現了一種新病毒，屬於冠狀病毒，命名為[[2019新型冠狀病毒]]（[[2019-nCoV]]）。
遭中共當局指稱是病毒來源的華南海鮮市場，在武漢肺炎疫情爆發的時間點並未出售蝙蝠，因此這表明了可能存在另一種中間動物宿主，該宿主將病毒轉移給人類。
最令人困惑的是，截至目前為止，沒有任何為了追查武漢新冠病毒來源或中間宿主，所進行的動物檢測報告，特別是華南海鮮市場動物樣本的檢測報告。
<ref name="Wuhan-21">[https://www.epochtimes.com/b5/20/2/12/n11862707.htm 武漢P4實驗室對蝙蝠身上病毒的改造 ]</ref>
瑞德西韦是由美國吉利德科學公司的執行副總裁楊台瑩博士[10]所領導開發的藥物，該公司於2016年在全球（包括中國）申請用此藥物治療冠狀病毒的專利，但此藥物尚未在美國以及任何國家獲得批准上市。[11][12]中國2019年武漢肺炎爆發期間，吉利德免費向中國重症患者提供试用瑞德西韦[13]，武漢P4實驗室與合作單位在2020年1月21日搶先申報中國發明專利《瑞德西韋抗2019新型冠狀病毒的用途》，聲稱是为了「保護國家利益」，引發爭議與討論[14]。對此，吉利德則回應「公司的核心关注在于病人，不希望卷入专利纠纷」[13]。