2006年当选国际拳击联合会(AIBA)主席，2010年和2014年两度获得连任。
2008年9月，吴经国被国际奥委会主席罗格任命为2016年奥运申办城市评估委员。
2012年5月22日在加拿大魁北克举办的夏季奥运单项运动总会(ASOIF)会员大会上，在全部28个夏季奥运单项运动总会主席投票选举中，以20票对8票击败自行车总会主席PatMc-Quaid获得代表ASOIF担任国际奥委会执行委员的资格。
2013年5月23日下午在台北宣布参选下届国际奥委会主席。
2015年8月，吴经国先生受聘南京体育学院奥林匹克学院客座教授。