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因香港周邊海水汙染，境內稀有物種[[馬蹄蟹]]數目於觀察記錄其間劇減九成，而[[綠海龜]]於2003年至2007年間，皆沒有返回[[南丫島]]深灣繁殖區生產<ref>[http://appledaily.atnext.com/template/apple/art_main.cfm?iss_id=20071116&sec_id=4104&subsec_id=11867&art_id=10426143 瀕危海洋生物面臨絕種 團體促政府推行全面保護措施] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20071118081717/http://www1.appledaily.atnext.com/template/apple/art_main.cfm?iss_id=20071116&sec_id=4104&subsec_id=11867&art_id=10426143 |date=2007-11-18 }}《蘋果日報 (香港)》，2007.11.16</ref>。

==生態事件==

===東涌河挖石事件===

大嶼山東涌河被揭驚人偷石事件<ref>[https://hk.lifestyle.appledaily.com/nextplus/magazine/article/20031211/2_3717328/%E6%8F%AA-%E5%87%BA-%E6%9D%B1-%E6%B6%8C-%E6%B2%B3-%E5%81%B7-%E7%9F%B3-%E9%BB%91-%E6%89%8B 揪出東涌河偷石黑手]，香港壹週刊，2003.12.11</ref>。河中多達四百噸的卵石，被人偷運到竹篙灣迪士尼興建人工湖。本來一片翠綠的東涌河，頓時變成爛地。偷石者原來是一名東涌鄉委會特別委員，他以清理河道為藉口，瞞騙村民，悄悄偷石。買石者是迪士尼總承攬建商中國建築工程（香港）有限公司，這間本港出名的工程承建商，在接受這批「賊贓」時，沒查清石頭來源，疏忽監管，連政府亦蒙在鼓裡。