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2016年11月22日台南市長賴清德參加[[成功大學]]領袖通識論壇，與會學生問及勞檢相關問題，詢問台南市政府的勞檢工作能不能向台北市看齊？有網友在PTT發文稱賴清德回覆「要讓年輕人留在台南確實要先建立好的工作環境，但是對中小企業勞檢會造成民怨。」2016年11月23日 下午05:42 台南市政府的市政新聞急速回應：PTT網友扭曲賴市長成大談話，賴清德是說：「但這兩年來，我們積極勞檢，也有相當成效。甚至在和中小企業業者座談時，常被說『勞檢過多會造成民怨。』」「市府嚴正聲明，賴市長多次強調，保障年輕工作者條件是我們的責任。」<ref>{{cite news|author=台南市政府新聞及國際關係處發佈|title=有關PTT網友扭曲賴市長成大談話 深表遺憾 市府強調絕對極力維護勞工權益|url=http://www.tainan.gov.tw/tainan/dep_news.asp?id=%7B1A4A9645-7BA7-43A6-AEFF-3EC1BDA928B6%7D|work=台南市政府市政新聞|date=2016-11-23|accessdate=}}</ref><ref>{{cite news|author=辛啟松|title=賴清德：勞檢會造成民怨　被網友噓爆|url=http://www.appledaily.com.tw/realtimenews/article/new/20161123/995877/paperart_right|work=蘋果日報|date=2016-11-23|accessdate=2016-11-22}}</ref><ref>{{cite news|author=蔡文居|title=台南勞檢惹民怨？ 市府：批踢踢貼文扭曲市長談話|url=http://m.ltn.com.tw/news/politics/breakingnews/1896015|work=自由時報|date=2016-11-23|accessdate=2016-11-22}}</ref>

2017年8月1日 台南市長賴清德上午參加台南市106學年度中小學暨幼兒園校長園長交接典禮，[[旺旺中時媒體集團]]1名電視台女記者提問台南市砸了重金253億去治水，被賴清德質疑數字從何處來。<ref>[https://tw.appledaily.com/new/realtime/20170801/1172988/ 【對話實錄】女記者問重金治水　賴清德連珠炮搶白]，蘋果日報</ref>