1941年6月，德军大举进攻苏联，当时的波克雷什金正在西部边境服役。首次空战的经历，给他留下了难以忘怀的回忆，由于缺乏经验，加之塔台指挥失误，他竟打下了一架自己的轰炸机。幸好没有人员伤亡，由于前线情况的复杂，他的过失得以从轻发落，但自己却非常懊悔。第二天，波克雷什金再次升空作战，干净利落地击落一架Me－109，戴罪立功。

波克雷什金第一次遇险是在雅西城郊。当时他为掩护战友侦察，勇敢地驾机俯冲歼敌，被地面德军的炮火击中了发动机。飞机失去了动力，速度越来越慢。波克雷什金凭着悯熟的驾驶技术，努力操纵着抖动不止的飞机，尽量延长滑翔的踞离，最后坠落在一片树林中。飞机摔毁了，波克雷什金的腿部也受了轻伤。为了返回部队，波克雷什金忍着饥饿、伤痛，疲惫地走了几天，终于在第4天回到了自己的机场。另一次是波克雷什金奉命执行侦察任务，在返航途中，他与4架德国Me－l09飞机遭遇。双方展开了激烈的空战。在敌众我寡、力量悬殊的情况下，波克雷什金击落了一架敌机，但他自己的座机也被击中。飞机的操纵系统完全失灵；波克雷什金同飞机一起向地面坠落。但他真是福大命大。只受了轻伤。波克雷什金又一次回到部队，并再次重返蓝天。

波克雷什金不仅是一名优秀的飞行员和指挥员，在发展空战战术理论方面也颇有建树。每次空战后，他都要总结经验，试图摸索出一套实用的和行之有效的空战战术。如当时他提出的将苏军以往的3机编队改为8机编队，以每两架一组背向太阳梯次配置的设想在空军各级指挥部掀起了轩然大波，曾被视为“狂妄”、“离经叛道”。但在1943年4月17日至6月10日的库班空战中，波克雷什金充分显示了他的战术水平和作战技能，以少胜多，凭借辉煌的战绩封住了批评者的嘴。从那时起，波克雷什金的8机编队战术得到承认并被推广到当时苏联所有的歼击机部队之中。飞行员们亲切地把这种8机编队称为“库班架子”。

在卫国战争中，波克雷什金独创和总结了许多空战特技动作和战术。他最喜欢并被实践证明能克敌制胜的公式是“高度—速度—机动—火力”。他所指挥的飞行员，巧妙地利用这些战术和飞行动作，消灭了大量的敌轰炸机和战斗机，而波克雷什金也被誉为“苏维埃空战战术之父”。

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