个旧市博物馆馆藏文物2600余件，各类石器、人牙化石和古生物化石标本 <ref>[https://www.sohu.com/a/65660732_386948 盘点：全球八大最珍惜古生物化石标本]，搜狐，2016-03-25</ref> 近300件。馆藏文物中以考古发掘出土的青铜器较具特色。如东汉铜俑灯、东汉铜三羊盒、铜量器等。

个旧市博物馆馆址为清乾隆三十年(1765年)始建的云庙，也称云省会馆，原系滇籍工商业主集会和商议采矿、销售和大锡的场所。座东南朝西北，是清朝中晚期和民国年间个旧经济、金融中心，兼有庙宇和会馆的功能。建国后辟为群众休息、游览和娱乐的场所。整体建筑原为三进四合院落，占地10,000平方米。十年浩劫期间，大部分被撤除，仅存第二进四合院的大殿廊庑和作为配殿的财神及凝云轩、六角亭 <ref>[https://www.sohu.com/a/405511896_569802 六角凉亭有什么好的寓意] ，搜狐，2020-07-03</ref> 、荷花池。现占地面积3000余平方米，建筑面积1600平方米。整个建筑布局为清代早期园林式建筑风格。馆内环境幽雅，景色宜人，是个旧市文明单位。个旧市人民政府和红河人民政府分别于1986年和1991年公布云庙为市级重点文物保护单位。