===清治時期===

重建工程由美濃的李阿水設計，於1955年6月動工，1957年10月完工。1958年1月3日（農曆十一月十四）子時舉行先烈牌位陞座大典，[[蔣介石|蔣中正總統]]特頒「民族正氣」牌匾，以及中央各院及部會首長多人贈匾。並將六堆抗日烈士入祀。「忠義亭」改稱「忠義祠」。

[[921大地震]]導致東西兩廳結構毀損，乃向六堆紳民募款重建，於2002年12月重建完成。2015年10月18日，[[馬英九]]總統親自主持『忠義亭300年正名』揭牌儀式，「六堆忠義祠」正名為「忠義亭」，並在2016年重修擴建完成後刻於廟額。

==祭祀==

===牌位===

1982年3月20日，六堆文教基金會與六堆忠義祠管理委員會招開會員大會暨六堆忠義祠東西廂廳修建籌備會議，決定供奉戰後時期的六堆客家人牌位。當年夏，六堆文教基金會總幹事鍾永發請鍾肇文到[[屏東縣政府]]兵役科抄錄六堆籍烈士名單，共得六堆因公殞暨戰亡烈士名單有四十八位，六堆忠義祠查得資料共四位。，

此祠神龕上神位計分前、中、後三排，有「清雍正乾隆嘉慶年間六堆民眾衛鄉平亂之忠勇義烈諸神位」、「粵東來台開創基創業之義士先烈之諸神位」、「清康熙年間六堆民眾衛鄉平亂之忠勇義烈諸神位」、「明延平郡王克服台灣粵東官民隨參戰役之忠勇義烈諸神位」、「清光緒乙未台民救台抗日六堆參戰之忠勇義烈諸神位」、「清道光咸豐同治年間六堆民眾衛鄉平亂之忠勇義烈諸神位」、「民國三十四年台灣光復台民歷參抗日之忠勇義烈諸神位」、「臺灣光復後六堆籍因公殞暨陣亡烈士」等牌位。前排曾只有一個大牌位的「中華民族列祖列宗神位」，被[[馮清春]]在2007年投稿認為喧賓奪主，應該是「清康熙年間六堆民眾衛鄉平亂之忠勇義烈諸神位」要在前面才對。

===祭典===

松崎仁三郎花近四年的時間調查、記錄，於1935年出書，為第一部以日本人觀點，記載跨越近八十年歷史的客家歷史書。他返日之後依然從事教育。[[臺灣戰後時期]]，六堆文化研究學會理事長劉錦鴻請屏東縣客家事務處協助，邀請曾彩金以三年的時間完成《嗚呼忠義亭》一書的翻譯與註解，於2011年3月6日在此祠舉辦新書發表會。當日包括多位六堆客家文化工作者、學者出席盛會。松崎仁三郎之孫松崎俊弘夫婦，特地從[[日本]][[茨城縣]]與會。松崎俊弘表示對於此次能夠代表祖父來到六堆忠義祠，向六堆客家鄉親述說祖父生平與編寫《呼嗚忠義亭》的經過，乃一大榮幸。