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作物遗传与种质创新国家重点实验室依托南京农业大学，科技部于2001年10月正式批准南京农大建设作物遗传与种质创新国家重点实验室，建设期一年，实验室正在建设中。现任实验室主任为张天真教授，学术委员会主任为刘大钧院士。
==科研领域==
实验室主要学术方向以水稻、小麦、棉花、大豆、玉米、白菜、黄瓜、萝卜等作物为主要对象，重点开展以下研究内容：
（1）作物遗传与基因表达。研究主要农作物及其近缘物种基因组的结构和功能，探明不同物种相似功能基因在结构、组成和调控上的相似性与区别；构建农作物基因组的遗传图谱；在阐明重要农艺性状遗传规律的基础上，定位、克隆和转移控制作物重要农艺性状基因。 [1]
（2）作物优异种质资源发掘与创新。探索优异种质资源收集、鉴定、保存和利用的新技术、新方法，实现优异种质资源的有效利用；利用染色体工程和基因工程手段，将亲缘植物中染色体、染色体片段及携带的有用基因导入栽培作物，创造优异的新种质。
（3）作物育种新方法和新品种选育。开展分子标记辅助选择育种技术和转基因育种技术研究，建立分子育种技术平台；将生物技术、数量遗传与常规育种技术结合，建立可行的品系改良方法和群体结构改良策略；培育符合国民经济发展需要，目标性状有重大突破的作物新品种（系）。
==项目成果==
自实验室建设以来，共承担美国McKnight基金和 “863”计划等近100项科研课题，拥有近2000万元的科研经费。近年来在国内外刊物上发表论文86篇，出版专著5部。此外，审定推广农作物新品种8个，批准发明专利3项，成果和技术转让11项，为我国农业生产和农业科学发展作出了重要贡献。获国家科技进步一、二等奖各1项（合作），国家科技发明奖三等奖1项，部（省）级奖14项。
==科研团队==
实验室现有固定研究人员36名，其中中国工程院院士2名、国家杰出青年科学基金获得者2名、教育部跨世纪人才3名。36名固定人员中，有教授17名（45岁以下的10名）、博士生导师14名（占教授总数的82.3%）、副教授10名（90%具博士学位）。在站博士后3名。实验室学术委员会由15名国内知名的各学科带头人组成，中青年科学家占学术委员会的2/3。
==科研领域==
实验室主要学术方向以水稻、小麦、棉花、大豆、玉米、白菜、黄瓜、萝卜等作物为主要对象，重点开展以下研究内容：
（1）作物遗传与基因表达。研究主要农作物及其近缘物种基因组的结构和功能，探明不同物种相似功能基因在结构、组成和调控上的相似性与区别；构建农作物基因组的遗传图谱；在阐明重要农艺性状遗传规律的基础上，定位、克隆和转移控制作物重要农艺性状基因。 [1]
（2）作物优异种质资源发掘与创新。探索优异种质资源收集、鉴定、保存和利用的新技术、新方法，实现优异种质资源的有效利用；利用染色体工程和基因工程手段，将亲缘植物中染色体、染色体片段及携带的有用基因导入栽培作物，创造优异的新种质。
（3）作物育种新方法和新品种选育。开展分子标记辅助选择育种技术和转基因育种技术研究，建立分子育种技术平台；将生物技术、数量遗传与常规育种技术结合，建立可行的品系改良方法和群体结构改良策略；培育符合国民经济发展需要，目标性状有重大突破的作物新品种（系）。
==项目成果==
自实验室建设以来，共承担美国McKnight基金和 “863”计划等近100项科研课题，拥有近2000万元的科研经费。近年来在国内外刊物上发表论文86篇，出版专著5部。此外，审定推广农作物新品种8个，批准发明专利3项，成果和技术转让11项，为我国农业生产和农业科学发展作出了重要贡献。获国家科技进步一、二等奖各1项（合作），国家科技发明奖三等奖1项，部（省）级奖14项。
==科研团队==
实验室现有固定研究人员36名，其中中国工程院院士2名、国家杰出青年科学基金获得者2名、教育部跨世纪人才3名。36名固定人员中，有教授17名（45岁以下的10名）、博士生导师14名（占教授总数的82.3%）、副教授10名（90%具博士学位）。在站博士后3名。实验室学术委员会由15名国内知名的各学科带头人组成，中青年科学家占学术委员会的2/3。