耶尔辛氏菌属是属于革兰氏阴性菌（Gram negative） <ref>[https://www.sohu.com/a/226597526_100069925 革兰氏阴性菌与大肠杆菌 ]，搜狐，2018-03-28</ref> ，双球株杆菌，和其他肠细菌相似，它有新陈代谢作用。鼠疫杆菌能产生反吞噬细胞的黏液。该生命体在隔离培养时是可动的，但在哺乳动物寄主里时会变成不可动的。

第三次鼠疫大流行期间，鼠疫杆菌于1894年由巴斯德研究所（Pasteur Institute）的法国医生和细菌学家亚历山大·耶尔辛在香港鼠疫大流行时所发现。耶尔辛是巴斯德的学生。北里柴三郎，一名日本细菌学家和科赫（Robert Koch）的学生，当时也正在从事寻找鼠疫病原体的研究。然而，耶尔辛先一步确定鼠疫 <ref>[https://www.sohu.com/a/410905441_652549 关于鼠疫，您应该知道的！ ]，搜狐，2020-08-01</ref> 和鼠疫杆菌的关系。这个细菌原被称为鼠疫巴斯德氏杆菌（Pasteurella pestis），后来被重新命名为鼠疫耶尔辛氏杆菌（Yersinia pestis）。[2][3]