DNA微陣列

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DNA微陣列是全國科學技術名詞審定委員會審定、公布的科技術語。

漢字，中國古人智慧的結晶。千百年間，它經歷了「甲金篆隸草楷行」的發展。從記錄的工具到藝術的載體，它的身上，傾注了無數先人的心血。

目錄

名詞解釋

DNA微陣列（DNA microarray）又稱DNA陣列或DNA芯片，比較通俗的名字是基因芯片（gene chip）。是一塊帶有DNA微陣列（micorarray）塗層的特殊玻璃片，在數平方厘米之面積上安裝數千或數萬個核酸探針，經由一次測驗，即可提供大量基因序列相關資訊。它是基因組學和遺傳學研究的工具。研究人員應用基因芯片就可以在同一時間定量的分析大量(成千上萬個)的基因表達的水平，具有快速、精確、低成本之生物分析檢驗能力

DNA微陣類型

基因芯片的製作方式基本可分為以下幾型：

Stanford型

由美國斯坦福大學開發的cDNA array的製作方法，將預先合成好的核酸探針布放於玻片載體上。 優點：設計較長的探針長度可增加專一性。 缺點：芯片密度較光罩法低，並須有良好的保存設計。

這種方法又可分為點製法與印製法。

點製法是小規模生產或實驗室自製的低密度芯片，以機械手臂上帶有毛細作用的細微刻痕的鋼針，將核酸探針溶液點放於玻片或聚酯纖維膜上。成本低廉，適合探針數少或製造需求量不大的狀況。

印製法是從噴墨打印機的方式變化而來，用加熱氣泡的方式將核酸探針印於玻片上。使用製作良好的噴頭可同時實現高密度、長探針的基因芯片；例如PhalanxJet。

原位合成法

原位合成(in situ synthesised)，是原來用於電子芯片製作的光刻法(Photolithography)，轉為核酸序列的合成技術。利用光罩控制反應位置，將核苷酸分子依序列一個一個接上去；可大量生產超高密度的芯片。由於製程與光罩成本等因素，這種方法做出的探針長度約在25-mer以下；因此同一個基因需要多個探針對應，以避免誤判。主要生產廠有 Affymetrix、Roche NimbleGen等。

微珠布放法

Illumina公司有其獨特的微珠陣列，將核酸探針製作於微小顆粒上，再將其布放於特製玻片。

qPCR array

在96孔或384孔標準PCR盤或384孔微流體盤中，預先合成好即時PCR引子與探針，將檢體注入後以定量PCR方式進行反應與偵測分析。分析量比傳統芯片少，屬於低密度陣列，但兼具準確定量與定性；並且設備與技術門檻低，一般分子生物實驗室即可自行操作。 新的中密度qPCr array：OpenArray是Applied Biosystems(應用生命系統公司，隸屬於Life Technologies集團)產品，在玻片大小的疏水性基板中分為數十個矩陣區域；矩陣內為親水性表面的微孔，有一組預先合成好的引子與探針。現有的規格是每片玻片有12*4 (48)個矩陣區域，每個區域為8*8 (64)孔。預計2012年有新的12K芯片與專用機台上市。