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胡璐璐

胡璐璐
圖片來自搜狗網

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目錄

工作經歷

研究員,復旦大學,生物醫學研究院(2020.11-至今) 博士後 芝加哥大學(2015.2-2020.9)

教育經歷

博士,復旦大學,生物醫學研究院(2009.9-2014.6) 學士,蘇州大學,生命科學學院(2005.9-2009.6) 所獲人才項目

所獲獎項

Excellent Ph. D of Fudan University and Shanghai City,2014 Graduate Star of Scientific Research of Fudan University,2014 Chicago Fellow Award,2015-2017 The Chicago Biomedical Consortium (CBC) fellowship,2016-2017 Leukemia & Lymphoma Society Special Fellow,2017-2020

研究方向

1.課題組成功研發了超微量,低成本單鹼基分辨率的表觀基因組和轉錄組檢測技術,該技術不依賴於高通量測序,僅需1 ng 血液中抽提的cfDNA就可以低成本(低至300元)檢測DNA甲基化和RNA m6A修飾進行單鹼基分辨率的定量分析,無需複雜的數據處理,使用簡單方便,用戶友好,在臨床方向有很好的應用前景。 2.課題組基於「split-pool」策略成功開發了單細胞尺度的DNA 5hmC測序技術,可以基於DNA 5hmC修飾對神經細胞進行精細分群,為研究腦科學和腦疾病中的單細胞DNA 5hmC特徵提供了實用的工具。 3.研發檢測RNA亞細胞定位的新技術。目前研究RNA亞細胞定位的技術APEX-Seq需要過表達質粒或者慢病毒感染,對細胞狀態影響較大。課題組開發無需過表達質粒或者慢病毒感染的原位擴增技術,來檢測無膜細胞器例如P-body, nuclear speckle, stress granule 和autophagosome中的RNA含量和豐度。 4.以往的認知中,細胞膜外表面分布着蛋白質,脂類以及糖鏈修飾,然而最新的研究表明,細胞膜外表面存在被糖基化修飾的RNA。有一些膜蛋白,例如P62細胞自噬受體受到小RNA的調控。課題組研發細胞膜外表面RNA的擴增和檢測技術,並且專注於研究細胞膜外表面RNA的結合蛋白和詳細功能,探索受到RNA調控的膜蛋白種類和具體機制。

代表論文

1、m6A RNA modifications are measured at single-base resolution across the mammalian transcriptomeLulu Hu*#, Shun Liu*, Yong Peng*, Ruiqi Ge,* Rui Su*, Chamara Senevirathne, Bryan T. Harada, Qing Dai, Jiang bo Wei, Lisheng Zhang, Ziyang Hao, Liangzhi Luo, Huanyu Wang, Yuru Wang, Minkui Luo, Jianjun Chen#, Mengjie Chen# & Chuan He# Nat Biotechnol. 2022 Mar 14. doi: 10.1038/s41587-022-01243-z. (* represents equal contribution and # represents corresponding)

2、Hu L*, Liu Y*, Han S*, Yang L*, Cui X, Gao Y, Dai Q, Lu X, Kou X, Zhao Y, Sheng W, Gao S, He X, He C. Jump-seq: Genome-Wide Capture and Amplification of 5-Hydroxymethylcytosine Sites. J Am Chem Soc. 2019 Jun 5;141(22):8694-8697. doi: 10.1021/jacs.9b02512. Epub 2019 May 23.


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參考文獻