中心主要的教学科研方向包括古人类与古环境、微痕考古、[[文物]]保护技术、田野考古技术等领域，特别是在古人类与古环境、微痕考古两个研究领域具有较强实力，与中科院古脊椎动物与古人类研究所密切合作，成为了国家“973”项目 <ref>[http://www.ebiotrade.com/newsf/2009-10/20091027171350633.htm 973项目首席科学家高校排名]，生物通，2009-10-28</ref> 、国家自然基金项目和中国科学院知识创新工程重要方向项目的重要参与单位。

2004年——应[[三峡工程]]建设等大型基建的需要，重庆师范大学经国家教委批准，在国家财政部和国家文物局等相关部门大力支持下，开设考古学 <ref>[https://www.sohu.com/na/457153774_120968537 考古学专业大盘点] ，搜狐，2021-03-24 </ref> 及博物馆学本科专业。同年，国家财政部投入600万元专项经费用于考古学及博物馆学实验室建设。