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JR東日本的在來線各線直通如下。JR貨物的貨物列車皆作為[[鐵路公司|第二種鐵道事業]]運行。
{{Color|#f68b1e|■}}[[高崎線]]：此站的所屬線<ref>『停車場変遷大事典 国鉄・JR編』JTB 1998年</ref> ，並以此站為終點。往[[埼玉縣]]與[[東京]]都心方向的大動脈，在[[上野站|上野]]到發。另外可途經[[池袋站|池袋]]、[[新宿站|新宿]]、[[大崎站|大崎]]、[[武藏小杉站|武藏小杉]]、[[橫濱站|橫濱]]等直通運行至[[東海道線 (JR東日本)|東海道線]]的[[湘南新宿線]]列車，途經[[上野站|上野]]、[[東京站|東京]]、[[品川站|品川]]直通運行至東海道線的[[上野東京線]]列車到發。另外與下述的上越線、信越本線軌道接續可以直通，但現在定期列車只限直通上越線、兩毛線、吾妻線。（往吾妻線的直通只限特急）
{{Color|#00b2e5|■}}[[上越線]]：以此站為起點，通往[[新前橋站|新前橋]]、[[澀川站|澀川]]、[[水上車站 (日本)|水上]]、[[土合站|土合]]、[[越後湯澤站|越後湯澤]]方向。普通電車往土合方向需要在水上站轉乘。
正式的軌道名稱上只有以上3條路線，但上述路線的中途站分岔出以下各線（對於這些路線JR貨物不持有鐵道事業免許）的列車都直通至此站，前述的3條路線合計6方向的列車到發。
{{Color|#b4aa96|■}}[[八高線]]：[[高麗川站|高麗川]]方向起北上，由[[倉賀野站|倉賀野]]<ref group="注釈"> ， 嚴格而言[[北藤岡站|北藤岡]]－倉賀野間的渡線（舊小野信號所附近）。</ref>起途經高崎線直通至此站3號月台。曾經有由高麗川直通至[[拜島站|拜島]]、[[八王子站|八王子]]方向的列車，後來因為高麗川－八王子間電氣化，使用路段以高麗川為界南北分斷，高崎開出的定期運用只直達高麗川。
{{Color|#ffd400|■}}[[兩毛線]]：[[新前橋站|新前橋]]起途經上越線直通。高崎線起包括特急的一部分列車作為「高崎·兩毛線」直通至[[前橋站|前橋]]。