2004年，恢复文物管理办公室，实行“两块牌子，一套人马”的管理体制，现有工作人员8名。其中大专以上文化4名，中学文化4名，获馆员职 称1 称<ref>[https://www.sohu.com/a/321859577_120174366 什么是职称？为什么要评职称？]，搜狐，2019-06-20</ref>1 名，技师1名。内设陈列科、保管部、保卫科、办公室等机构。博物馆成立之初即借用在省级文物保护单位“安福孔庙”内办公。

该馆利用孔庙的乡贤祠和东西两庑等设置8个展厅和一个电教室。展厅以板块拼装形式悬挂图片和文字说明，并征集了大量文物和实物资料进行集中展示。主要内容有：序幕馆、古代文明、武功山人文自然景观 <ref>[https://www.sohu.com/a/463474237_563449 武功山独特美景介绍 武功山攻略大全]，搜狐，2021-04-28</ref> 、革命斗争、安福古代文化名人、工农业成果、科教文卫成果等。2000年利用孔庙右巷道增设石雕石刻陈列苑，2003年增设安福风光摄影精品屋，总面积达600平方米。1998年原吉安地委、行署和安福县委、县政府均在孔庙挂牌，公布为地县两级爱国主义教育基地。