尹玉琦非常重视国内学术交流活动。他在各级植保学会中担任理事、常务理事等职，并积极参加和组织学会的学术交流，努力提高学院和新疆的学术水平。在学会中，他常就生产中出现的问题向有关部门提出合理化建议，组织科研人员立题研究，合作攻关。他经常和其他[[专家]]一道深入生产第一线进行调查研究，帮助生产单位解决一些实际问题。由于他在学术交流活动中的突出表现，各级学会给予他一系列表彰。

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