巴彦淖尔市交通运输局是巴彦淖尔市的政府组成部门，职责是贯彻执行国家、自治区关于交通运输的法律、法规、方针、政策、标准和规划并监督实施；组织拟定全市交通行业发展规划，承担全市综合运输体系的规划协调；承担公路、水路的建设、养护、管理和交通运输市场监管职能；指导城乡客运及有关设施规划和管理；监测和协调路网运行情况；对全市交通运输企业行使管理职能。