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''' 蛋白质组学 ''' （英语：proteomics，又译作蛋白质体学），是对 [[ 蛋白质 ]] 特别是其结构和功能的大规模研究，是在90年代初期，由马克·威尔金斯(Marc Wikins)和学者们首先提出的新名词。更重要的是， [[ 基因组 ]] 是相当稳定的实体，而蛋白质组通过与基因组的相互作用而不断发生着改变。一个生命体在其机体的不同部分以及 [[ 生命 ]] 周期的不同阶段，其蛋白表达可能存在巨大的差异。

蛋白质组是由有机体或系统产生或修饰的整套蛋白质。 这随着 [[ 时间 ]] 和 [[ 细胞 ]] 或有机体经历的不同要求或压力而变化。蛋白质组学是一个跨学科的领域，它从人类基因组计划的 [[ 遗传 ]] 信息中受益匪浅，它还涵盖了新兴的科学研究和从细胞内蛋白质组成，结构和其独特活动模式的整体水平探索蛋白质组学。它是功能基因组学<ref>[https://www.med66.com/html/2009/1/liujia7600242026181900212216.html 功能基因组学 ]，医学教育网，2009-1-8</ref>的重要组成部分。

蛋白质组学研究的关键 [[ 技术 ]] 包括质谱分析、X射线晶体学、 [[ 核磁共振 ]] 和凝胶电泳。

有两种蛋白质组学方法：活体样品研究和重组蛋白合成。在第二种情形下，用遗传工程方法来克隆待合成的DNA模板，以及把这些 [[ 基因 ]] 剪切到宿主细胞（典型的是细菌）中，后者被培养用于大规模蛋白表达。

接着，被合成蛋白需要被从宿主细胞中提取和纯化。纯化的蛋白随后通过 [[ 结晶 ]] （及X-射线晶体衍射）或核磁共振来确定其结构。

在基因组学和 [[ 转录组学]]<ref>[http://www.360doc.com/content/17/1101/22/19913717_700142156.shtml 组学专题-转录组学 ]，个人图书馆，2017-11-01</ref>之后，蛋白质组学是在生物系统研究的下一个步骤。它是比基因组更为复杂，因为 [[ 生物 ]] 的基因组或多或少还是恒定的，但是蛋白质是细胞和细胞各不相同，并且在时间上各不相同。在不同的细胞类型中独特的基因被表达，这意味着在细胞中所产生的即使是基本的蛋白质组也需要被鉴定。

过去这种现象是通过RNA分析完成的，但发现它与蛋白质含量不相关。现在已知mRNA并不总是 [[ 翻译 ]] 成蛋白质，并且对于给定量的mRNA产生的蛋白质的量取决于它从中转录的基因和细胞的当前生理状态。蛋白质组学证实了蛋白质的存在并提供了存在数量的直接量度。