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虽说“神舟一号”飞船是中国航空史上的里程碑，但是在技术方面存在的一些差距是不可否认的。由于是首次试发实验，因此与无人飞船飞行试验相比尚有一些技术距离，比如为提高航天员安全而增加的火箭逃逸系统和故障检测系统，虽然这些系统参加了任务，但是如果发生一些意外事件，这些系统不具备逃逸功能等。因此，要在下一步的飞船技术工作上进行改进和完善，提高飞船的安全系统，完美地发展空间技术。