2008年3月22日，以765萬9014票，58.45%的得票率當選第12任總統，是迄今中華民國得票率最高的[[中華民國總統及副總統在台灣之公民直接選舉與罷免|公民直選]]總統，同年5月20日就職。2012年再度當選 ， 連任第13屆總統。