*2017年台北地檢署重新調查2014年簽結的中廣案，可能於當年8月底前傳喚馬英九。據鏡週刊報導，北檢調查發現，趙少康稱只買廣播事業，資產仍是國民黨的，但矛盾在於趙少康入主中廣後，卻免費使用中廣松江大樓等房地，並將林森大樓出租。知情人士透露，粗估10餘年來國民黨短少租金收入達15億元，黨產主要負責人也均未積極催收，這宗交易案是否涉及背信罪的重要關鍵。<ref>[http://www.chinatimes.com/realtimenews/20170809001442-260402 馬英九圖利趙少康15億？10年未收中廣租金] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170810051125/http://www.chinatimes.com/realtimenews/20170809001442-260402 |date=2017-08-10 }}</ref>
=== 中華民國總統時期 ===
*大埔事件
*批評陳菊關於[[高雄的負債]]，引起[[李昆澤]]回批馬對高雄的政見全部跳票，更時常展露[[重北輕南]]的心態。<ref name="NOWnews 今日新聞 2010">{{cite web | author=陳明成 | title=馬英九陪黃昭順拜票 指前朝執政高雄進步慢 | website=NOWnews 今日新聞 | date=2010-11-14 | url=https://www.nownews.com/news/20101114/612703 | language=zh | access-date=2018-04-11 | deadurl=no | archiveurl=https://web.archive.org/web/20180411174526/https://www.nownews.com/news/20101114/612703 | archivedate=2018-04-11 }}</ref>
*陳雲林事件{{seealso|陳雲林訪臺爭議與衝突}}
*消費券爭議{{seealso|振興經濟消費券}}2009年1月18日，馬政府舉債858億，發放[[振興經濟消費券|消費券]]來刺激經濟成長<ref>[http://tw.info.yahoo.com/3600/index.html 消費券特輯－血拼愛台灣] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20121105152036/http://tw.info.yahoo.com/3600/index.html |date=2012-11-05 }}</ref>，發行之初政府預估可貢獻GDP 0.66~1%<ref>[http://udn.com/NEWS/NATIONAL/NATS1/4699235.shtml 許玉君、李明賢，消費券效應 GDP估增0.66~1百分點，聯合報，2009-01-20] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20090227171712/http://udn.com/NEWS/NATIONAL/NATS1/4699235.shtml |date=2009-02-27 }}</ref>。但經建會自估對GDP之經濟效益僅有0.3至0.5%，效果未如預期<ref>{{cite news |language =zh-tw |author =康仁俊 |url =http://www.nownews.com/2011/01/18/320-2682784.htm |title =失業率亞洲四小龍最高 謝長廷：證明消費券是失敗政策 |publisher =[[今日新聞網]] |date =2011-01-18 |accessdate =2011-11-12 |deadurl =no |archiveurl =https://web.archive.org/web/20130927201808/http://www.nownews.com/2011/01/18/320-2682784.htm |archivedate =2013-09-27 }}</ref><ref>{{cite news |language=zh-tw |author=曹逸雯 |url=http://www.nownews.com/2009/03/24/320-2426718.htm |title=1、2月零售業營業額年減4.65% 消費券乘數效應不大 |publisher=[[今日新聞網]] |date=2009-03-24 |accessdate=2011-11-12 |deadurl=no |archiveurl=https://web.archive.org/web/20130927201919/http://www.nownews.com/2009/03/24/320-2426718.htm |archivedate=2013-09-27 }}</ref><ref>{{cite news |language=zh-tw |author=何旭如 |url=http://www.epochtimes.com/b5/9/5/1/n2513204.htm |title=消費券替代率逾6成 經建會尚不考慮再發 |publisher=[[中央社]] |date=2009-05-01 |accessdate=2011-11-12 |deadurl=no |archiveurl=https://web.archive.org/web/20130927075315/http://www.epochtimes.com/b5/9/5/1/n2513204.htm |archivedate=2013-09-27 }}</ref>，2009年度第一季經濟(負)成長率為 -10.24%，當年度國民所得降至16,359美元，(負)成長率 -5.98%。
*莫拉克風災{{seealso|八八水災}}2009年8月8日，[[颱風莫拉克 (2009年)|莫拉克]]颱風襲卷台灣，南台灣災情慘重，小林村遭到滅村，死亡及失蹤人數近700人，損失將近兩千億台幣<ref>{{cite news|url=http://udn.com/NEWS/NATIONAL/NATS2/8231704.shtml|title=治水沒人做…1個颱風 2千億飛了|deadurl=yes|archiveurl=https://web.archive.org/web/20131019193137/http://udn.com/NEWS/NATIONAL/NATS2/8231704.shtml|archivedate=2013-10-19}}</ref>，這是台灣自[[921大地震]]以來死傷最嚴重的災情。政府防災救援不力，引發廣泛民怨，馬政府施政滿意度嚴重下挫。<ref>{{cite news|publisher=自由電子報 |title=農漁恢復正常 至少要等半年 |url= | date=2009-08-14}}</ref>。
*油電雙漲<ref>{{cite news|url=http://www.gvm.com.tw/Boardcontent_20146.html|title=預期心理影響大， 油電雙漲最衝擊弱勢|deadurl=no|archiveurl=https://web.archive.org/web/20150117081916/http://www.gvm.com.tw/Boardcontent_20146.html|archivedate=2015-01-17}}</ref><ref>{{cite news|url=http://mag.nownews.com/article.php?mag=1-28-11545|title=油電雙漲痛在哪裡？|publisher=財訊雙週刊}}{{dead link|date=2018年4月 |bot=It's gonna be awesome |fix-attempted=yes }}</ref>{{see also|519嗆馬踹共大遊行}}
*開放瘦肉精美牛進口
*林益世索賄案
*台北雙子星弊案
*廣大興28號事件
*洪仲丘事件
*核四爭議{{see also|2014年林義雄反核四禁食行動|台灣反核運動#2011年福島第一核電廠事故以後|台灣反核遊行#福島核事故以後}}日本福島事故發生後，台灣部分民意反核{{FACT}}，使主張興建核四的馬政府支持度受特定媒體操作下下滑，馬政府提出的穩健減核主張未獲反對黨支持，馬政府面對民間反核訴求與在野黨壓力，於2013年2月25日提出接受核四公投之主張。 <ref>{{cite news|title=核四停建 最快7月公投|url=http://www.appledaily.com.tw/appledaily/article/headline/20130226/34852185/%E6%A0%B8%E5%9B%9B%E5%81%9C%E5%BB%BA%E6%9C%80%E5%BF%AB7%E6%9C%88%E5%85%AC%E6%8A%95|accessdate=2014-04-26|newspaper=蘋果日報|date=2013-02-26|deadurl=no|archiveurl=https://web.archive.org/web/20130530034112/http://www.appledaily.com.tw/appledaily/article/headline/20130226/34852185/%E6%A0%B8%E5%9B%9B%E5%81%9C%E5%BB%BA%E6%9C%80%E5%BF%AB7%E6%9C%88%E5%85%AC%E6%8A%95|archivedate=2013-05-30}}</ref>但之後因[[九月政爭]]與選舉將近，國民黨決議未完成安檢前，暫緩公投 <ref>{{cite news|title=馬下鄉 300警架網防「鞋攻」|url=http://www.appledaily.com.tw/appledaily/article/headline/20130927/35323245/|accessdate=2014-04-26|newspaper=蘋果日報|date=2013-09-27|deadurl=no|archiveurl=https://web.archive.org/web/20140426214604/http://www.appledaily.com.tw/appledaily/article/headline/20130927/35323245/|archivedate=2014-04-26}}</ref>。前民進黨主席[[林義雄]]於2014年4月22日展開[[2014年林義雄反核四禁食行動|反核四禁食行動]]，在各界壓力之下，馬政府於4月27日決議「核四一號機不施工、只安檢，安檢後封存；核四二號機全部停工」<ref>{{cite news|url=http://www.stormmediagroup.com/opencms/news/detail/94aee621-ce12-11e3-9580-ef2804cba5a1/?uuid=94aee621-ce12-11e3-9580-ef2804cba5a1|title=政院：核四無政策變更問題|deadurl=no|archiveurl=https://web.archive.org/web/20140427200144/http://www.stormmediagroup.com/opencms/news/detail/94aee621-ce12-11e3-9580-ef2804cba5a1/?uuid=94aee621-ce12-11e3-9580-ef2804cba5a1|archivedate=2014-04-27}}</ref>。但引發台灣反核風潮的日本，在2014年11月份決定重啟核電，主因是無法承受廢核導致日本電價調漲兩成，衝擊民生與經濟，所以安倍晉三政府決定重啟核電。<ref>[http://www.appledaily.com.tw/appledaily/article/international/20141108/36195514/ 311後 日首座核電廠重啟] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20150113063047/http://www.appledaily.com.tw/appledaily/article/international/20141108/36195514/ |date=2015-01-13 }}</ref>
*服貿爭議 {{see also|海峽兩岸服務貿易協議存查爭議|太陽花運動}}
*毒澱粉、食品安全事件 {{main|2013年臺灣毒澱粉事件|2013年臺灣食品安全問題事件}}
*洪仲丘事件：國軍士官洪仲丘遭虐死事件，引起廣大民意反彈，引發[[白衫軍運動]]，政府回應民意，廢除軍審制度，將非戰爭時期的軍人司法案件移交給一般法院處理<ref>[http://www.ettoday.net/news/20130807/252137.htm 軍事院檢明年初全面裁撤 200名軍法人員辦移轉或退伍] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20150518091412/http://www.ettoday.net/news/20130807/252137.htm |date=2015-05-18 }}</ref>。{{see also|洪仲丘事件|白衫軍運動|公民1985行動聯盟}}
*黑心油事件{{main|2013年臺灣食用油油品事件|2014年台灣劣質油品事件}}
*九月政爭<ref>[http://www.nownews.com/n/2017/04/14/2483237 教唆洩密案開庭 馬英九答辯全文] {{webarchive|url=https://web.archive.org/web/20170415062003/http://www.nownews.com/n/2017/04/14/2483237 |date=2017-04-15 }}2017.04.14，NOWnews 今日新聞，江昱逵</ref>{{see also|九月政爭|各方對九月政爭的反應}}檢察總長[[黃世銘]]兩度至總統官邸報告[[九月政爭#特偵組公開部分監聽內容|王金平關說案]]後，因[[王金平]]幫[[柯建銘]]的[[九月政爭#柯建銘全民電通背信案|全民電通背信案]]關說法務部長[[曾勇夫]]。2013年9月8日，馬英九於王金平出國時召開總統府記者會，公開譴責王金平，表示「這不是關說關說，什麼才是關說」。馬英九強勢主導國民黨[[中國國民黨中央委員會考核紀律委員會|考紀會]][[九月政爭#中國國民黨撤銷王金平黨籍|開除王金平黨籍]]。關說疑雲爆發後，[[特偵組]]被立委揭發[[九月政爭#特偵組被指監聽國會|監聽國會總機]]，特偵組也監聽林秀濤檢察官等人。王金平關說案由台北地檢署調查後，查無事證結案，相關人等皆未起訴。[[黃世銘]]因向馬英九報告關說案及監聽內容，被告發涉嫌妨礙司法、以泄密罪起訴。2014年3月21日，台北地院一審判決[[九月政爭#黃世銘泄密案|黃世銘泄密案]]有罪、徒刑1年2個月，黃世銘宣布請辭。[[九月政爭#王金平確認黨籍存在訴訟|王金平黨籍訴訟案]]高等法院二審宣判，王金平勝訴。2014年10月22日，國民黨上訴最高法院，後於[[朱立倫]]擔任主席時撤告。
*太陽花運動 {{main|太陽花運動}}
*馬習會
*涉及司法案件
**2016年5月19日，台北地檢署宣布，目前偵辦有關馬英九因刑事豁免權而暫時簽結之案件，俾於總統卸任後依法重啟偵查，經清查結果，包括現偵辦中及暫時簽結之案件，總計24件（偵字案2件，他字案22件），暫時簽結部分將於5月20日後依法重啟偵辦。
**台北地檢署原受理多件關於指訴馬英九與黃前檢察總長共同涉嫌違反通訊保障及監察法、個人資料保護法之案件，因告訴人柯建銘向臺灣臺北地方法院提起自訴在先，已依刑事訴訟法第 323 條第 2 項規定停止偵查，將案件移送台北地方法院併案審理。
== 個人軼聞 ==