重庆金融学院实行理事会领导下的院长负责制 <ref>[http://www.fx361.com/page/2020/0810/6940707.shtml 院长负责制思考 ]，参考网，2020-08-10</ref> 。理事长由时任重庆市副市长凌月明担任，院长由重庆工商大学校长、博士生导师杨继瑞担任。学院理事会由政府部门、金融机构和学校联合组成，履行研究和制定学院章程、发展规划、培养方案、院长遴选、师资聘用等职能。[[中国人民银行]]重庆营管部、中国银监会重庆监管局、中国证监会重庆监管局、中国保监会重庆监管局、西南证券公司等单位均是学院的理事单位。学院将面向全国招聘执行院长、学科带头人和教学科研团队。

学院联合海内外著名商学院，已开设特许[[金融]]分析师（CFA）、国际结算师（ISM）、特许公认会计师（ACCA）、中法双学士2+2或1+3项目、中加双学士2+2项目、数学金融学士，以及金融学硕士、金融软件硕士（MSE）、金融MBA（工商管理硕士） <ref>[https://www.sohu.com/a/395971850_643937 MBA到底有多大价值？究竟值不值得读？ ]，搜狐，2020-05-18</ref> 、金融EMBA（高级管理人员工商管理硕士）、[[英国林肯大学]]“国际商务硕士（MIB）”、金融学博士、工商管理博士等项目。