TATA框
TATA框(TATA box / Hogness box)详细信息在真核生物基因中,Hogness等先在珠蛋白基因中发现了类似原核生物的Pribrow 区的Hogness 区,即TATA框(Goldberg-Hogness box或Hogness box),这是位于转录起始点上游-25~-30 bp处的共同序列。另外,在起始位点上游-70~-78 bp处还有另一段共同序列CCAAT,这是与原核生物中-35bp区(Sextama 区)相对应的序列.称为CAAT区(CAAT box)。是构成真核生物启动子的元件之一。其一致顺序为TATAATAAT(非模板链序列)
它约在多数真核生物基因转录起始点上游约-30bp(-25~-32bp)处,基本上由A-T碱基对组成,是决定基因转录始的选择,为RNA聚合酶的结合处之一,RNA聚合酶与TATA框牢固结合之后才能开始转录。诱变缺失后,引起转录位点改变,故其功能为保证转录的正确定位。在mRNA前体转录的起始过程中,需先由转录因子TF2和TATA框结合,形成稳定的复合物,然后由其他转录因子和RNA聚合酶按一定时空顺序与DNA结合形成转录起始复合物开始转录。[1]
目录
启动子如何识别TATA框,我是指蛋白怎么认识的碱基序列
启动子是顺式作用元件,位于DNA上,TATA框就是其中一种组成部分.识别启动子的转录因子,可以结合在RNA聚合酶上,帮助RNA聚合酶识别启动子,属于反式作用因子. TBP(TATA binding protein ,TATA结合蛋白,转录因子的组成部分)用β-折叠结合到DNA双螺旋的小沟上,能使TATAbox弯曲80°.主要结合在A、T碱基上,因为这样有利于扭曲使小沟开放. 除此之外,反式作用因子上有很多结构可以与DNA结合,比如 螺旋-转角-螺旋 ,锌指结构 ,亮氨酸拉链 ,螺旋-突环-螺旋 等,这些成为DNA结合域,与DNA结合后,反式作用因子上的转录激活结构域,可以与其他转录因子相互作用,激活RNA聚合酶,进行转录.[2]