乌审旗境内碱水湖泊较多，较大的有浩通音查干淖尔、毛敦查干淖尔、 [[ 巴嘎淖尔 ]] 、呼和套勒盖淖尔、苏日淖尔等。乌审旗境内主要河流有[[无定河]]、[[纳林河]]、[[海流图河]]等。