乌审旗境内碱水湖泊较多，较大的有浩通音查干淖尔、毛敦查干淖尔、巴嘎淖尔、呼和套勒盖淖尔、苏日淖尔等。乌审旗境内主要河流有[[无定河]]、 [[ 纳林河 ]] 、 [[ 海流图河 ]] 等。