尼玛县的河流主要有 [[ 江爱藏布 ]] 、 [[ 波仓藏布 ]] 、 [[ 达热藏布 ]] ，均为内陆河。

主要湖泊有 [[ 当惹雍错 ]] 、 [[ 昂孜错 ]] 、 [[ 布若错 ]] 、 [[ 依布茶卡 ]] 、 [[ 当穹错 ]] 等，湖面海拔均在4500米以上，其中布若错湖面海拔5158米。 [2-3] [8-10]