在中国境内流域面积大于100km²的支流有138条，大于1,000km²的支流有41条，大于5,000km²的支流有10条（ [[ 子曲 ]] 、 [[ 盖曲 ]] 、 [[ 昂曲 ]] 、 [[ 麦曲 ]] 、 [[ 金河 ]] 、 [[ 漾濞江 ]] 、 [[ 小黑江 ]] 、 [[ 威远江 ]] 、 [[ 南班河 ]] 、[[南拉河]]），大于10,000km²的支流有3条（ [[ 子曲 ]] 、 [[ 昂曲 ]] 、 [[ 漾濞江 ]] ）。由于中游行经滇西纵谷，较大的支流均分布于上游与下游。