2003年，为了促进企业科技进步，朱文臣又带领辅仁药业，在企业设有技术创新中心、产品开发公司的情况下，依然注册成立了河南医药科技开发有限公司，分别致力于对现有医药产品生产工艺的改进，剂型的完善，疗效的提升及新药品种的筛选和研制。以长线运营与短线动作相结合，承担项目与研发产品为互动，结合全国各大科研机构的科技信息和科研实力，进行卓有成效的运作，确保企业持续、健康的发展。 新世纪以来，朱文臣对辅仁的发展有了更为深远的企划，特别是中国入世以后，更坚定了他建立中国大型医药企业的信心。经过多方努力，联合省内几家大型医药企业，由辅仁作为主导企业，朱文臣提出了组建"河南省医药股份有限公司"的具体方案，该公司为河南省最大的医药企业，资产总量上市后迅速膨胀，成为了河南医药企业成长为国际品牌的大型航母。

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