集大成之作，成就极高。研究《周易参同契》、《悟真篇》，精深入微。仇兆鳌另好阴阳仙术，著有《古本周易参同契集注》、《悟真篇集注》，陶素耜推崇此书"事理贯通，深达道妙"、"美不胜收"，晚年幡然醒悟而止。