九三学社重庆市委员会的前身是九三学社重庆分社。1946年10月27日，九三学社重庆地方组织——重庆分社在上清寺国民外交协会召开成立大会，公推理事、监事15人。1951年9月3日，恢复重建九三学社重庆分社理事会。1952年9月，九三学社第二次全国工作会议决定各分社理事会改为分社委员会。1953年2月，分社召开社员大会，选举产生九三学社重庆市第二届分社委员会，“重庆分社理事会 <ref>[https://www.docin.com/p-2655561197.html 理事会及各岗位职责]，豆丁网，2021-05-06</ref> ”改称为“重庆分社委员会”。1984年5月，九三学社重庆分社召开社员代表大会，根据九三学社第四次全国社员代表大会修改的社章规定，经社中央批准，自本次代表大会起，“九三学社重庆分社委员会”改称“九三学社重庆市委员会”。1997年重庆直辖以来，九三学社重庆市委员会已历五届，现为第五届委员会。

第五届委员会有主委1人、副主委7人，常委22人，委员61人。常委会组成人员平均年龄52.28岁，其中，女同志5人、占22.73%，主体界别18人、占81.81%，专家学者9人、占40.91%，在政府、司法等行政机关任职11人、占50%，具有高级职 称18 称<ref>[http://society.sohu.com/a/586617217_100115346 评高级职称难吗？全流程及注意事项，赶快收藏~] ，搜狐，2022-09-20 </ref>18 人、占81.81%。委员平均年龄48.84岁，其中，女委员13人、占21.31%，主体界别46人、占75.41%，专家学者31人、占50.82%，在政府、司法等行政机关任职25人、占40.98%，具有高级职称48人、占78.69%。