九江市科协现有市级学会（协会、研究会）45个，企业科协17个，县（市、区、山）科协15个；市科协机关设置办公室、学会 <ref>[https://www.sohu.com/a/403613990_120669707?_trans_=000014_bdss_dkgyxqsP3p:CP= 为什么要加入学会？学会可帮你做什么？]，搜狐，2020-06-23 </ref> （国际）部、科普（青少年）工作部、机关党总支4个职能部室；有2个直属事业单位：九江市农村致富技术函授大学（科技进修学校）、九江市院士专家服务中心（咨询服务部）。

九江市科协的宗旨是：坚持以马列主义 <ref>[https://www.sohu.com/a/237702269_425345 马列主义基本原理至今未变，个别结论可以改变]，搜狐，2018-06-25</ref> 、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面贯彻落实科学发展观，团结和动员全市科技工作者以经济建设为中心，坚持科学技术是第一生产力的思想，实施科教兴市战略、人才强市战略和可持续发展战略，建设创新型九江。促进科学技术的繁荣和发展，促进科学技术的普及和推广，促进科学技术人才的成长和提高，促进科学技术与经济的结合。反映科学技术工作者的意见，维护科学技术工作者的合法权益。为经济社会发展服务，为提高全民科学素质服务，为科学技术工作者服务，推动社会主义经济建设、政治建设、文化建设和社会建设，构建社会主义和谐社会，为实现中华民族伟大复兴而努力奋斗。