祝桐君之父好琴，家有藏琴数十张，以“十二琴楼”专贮<ref>https://books.google.com.tw/books?id=eB5LAQAAIAAJ&q=%E7%A5%9D%E6%A1%90%E5%90%9B+%E5%90%8D%E5%87%A4%E5%96%88&dq=%E7%A5%9D%E6%A1%90%E5%90%9B+%E5%90%8D%E5%87%A4%E5%96%88&hl=zh-TW&sa=X&ved=0ahUKEwicvICouZrhAhUCvrwKHcojD24Q6AEIKjAA</ref>。祝桐君的哥哥[[祝凤鸣]]，字秋斋，继承了家学。祝桐君十九岁起从兄学琴三十多年。后来祝桐君到江浙作官，携琴而往，所至之处，皆以琴艺名噪一时。“以琴受业者，恒不远千里而来”。他的弟子中，以[[许海樵]]最为有名。