抗战全面爆发后的1941年，占领了北京的日本人一方面胁迫章广生等人在周口店发掘化石，一方面为夺取已经运回协和医学院的“北京人”化石继续寻找机会。已成为驻北京美军陆战队翻译的魏道培接到指示，和王福明一起再次肩负起保护化石安全的使命。日方以间谍冒充美方科学家福格尔的新助手安妮，进入了协和医[[学院]]，使得“北京人”化石的安全岌岌可危。鉴于情况危急，中方政府与美方达成协议，准备将“北京人”化石全部转运到美国。为了挫败[[日本]]人的阴谋，王福明以生命为代价，保护了真正的安妮，使日本间谍原形毕露。王福明的壮烈牺牲震撼了章广生，使其勇敢地担负起了王福明生前的使命。魏道培等人一方面调查仍然潜伏在医[[学院]]内部日本间谍的蛛丝马迹，一方面协助医[[学院]]和美军陆战队安排化石的转运工作。“珍珠港事件”前夕，在挫败了伊藤和世野井的一系列阴谋之后，化石得以安全地转移到陆战队军营，作为医学院内部的日本间谍刘文杰的身份也随之暴露。太平洋战争爆发，“北京人”化石在从北京向秦皇岛美军基地转移的途中不翼而飞，从此下落不明。

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