大蛇丸被十拳剑封印后，兜为了寻找真实的自己而去模仿大蛇丸的生存道路，获得了大蛇丸及其部下音忍五人众的能力，而且自己在龙地洞修炼了仙人模式，并扬言利用他人来伪装自己，探索世界的真理。在与佐助和鼬的战斗中陷入幻术[[伊邪那美]]。最后重拾自我，并前往战场治疗佐助。战后被允许在木叶开设孤儿院，回到自己最向往的生活。<ref>[https://mini.eastday.com/a/200412162159051.html 原创 药师兜没能复活的5位忍者，2人轻松秒杀他，3人无法被转生]，东方资讯，2020-6-4</ref>

“兜”的名字，是他在孤儿院时院长药师野乃宇起的名字；“药师”的姓氏则是继承了野乃宇的姓氏。“药师”一词源自传说中的神祇药师如来。传说中的药师如来能为信徒消除烦恼，免其受苦，消灾延寿，灭除一切灾劫病苦。另外，照字面意思，药师的名字正显示了其对药物（兵粮丸、凝血丸）及医术的精湛掌握，所以在漫画中发现药师兜使用过各种药丸，以及高级的医疗忍术。

“兜”（カブト）是一种日本古代[[武士]]的头盔。是兜初到孤儿院时，被院长随口起的名字。大蛇丸安插在木叶的间谍三人组——药师兜、[[赤胴铠]]和[[剑美澄]]，他们名字里的“兜”（カブト）、“铠”（ヨロイ）、“剑”（剣）都是武士的装束，这些名字似乎表达了他们想要隐藏间谍的真面目这一点。

'''养母''':[[药师野乃宇]]，对于兜来说，野乃宇对他一生的影响都是至关重要的，就像是自己的妈妈一样。

'''养子''':[[宇智波信]]的剩余克隆人们,外表上是少年男性。白色短发，皮肤苍白，衣服背面是宇智波一族家徽。仅双眼为写轮眼。

第三次忍界大战时期，兜在不知父母及名字的状况下被孤儿院院长药师野乃宇收留，幼年时期就天资聪颖，但由于视力不佳，因此院长将自己的眼镜送给兜，同时学会了医疗忍术，但在一次帮助木叶忍者疗伤时初次遇见了还是木叶忍者的大蛇丸，因此被大蛇丸发现他的天赋。后来[[志村团藏]]连同大蛇丸和一名油女一族成员突然出现在孤儿院，威胁曾在谍报部有“行走的巫女”之称、旧名药师野乃宇的院长前去长期侦察岩忍者村是否有拟定大规模作战计划，团藏在察觉到在窗外偷听的兜后，声称需要孩童成为木叶忍者来替补获得这次情报牺牲的团藏部下，并以补助金作为交换条件，成功将兜纳入自己麾下。<ref>[https://www.sohu.com/a/395828215_120458682 火影中的隐藏大佬，药师兜考试7次收集情报，“圆梦大师”有多强]，搜狐，2020-6-4</ref>

因这三名雨忍不擅长近身攻击，所以他们使用了自己擅长的幻术及分身术，并把自己的真身隐藏起来。他们的目的就是想利用分身消耗[[漩涡鸣人]]、兜他们的体力，等鸣人他们的查克拉用尽后，便现身解决他们。兜在与分身的战斗中，为了保护鸣人他们而被偷袭受伤。后雨忍三人的真身被发现，并被漩涡鸣人击败，成功取得“天之卷轴”。兜及鸣人四人顺利到下一场考试的试场。但就在中忍预赛考试前夕，他与队友私下跟前来夺取佐助的大蛇丸会面，汇报了佐助的情况及表现。之后以受伤为由先行退出第三场考试的预赛，让鸣人为他感到遗憾。然而事实上当时只有我爱罗能够打败拥有上忍实力的兜。

中忍选拔试退出后，就一直活跃于大蛇丸身边，并跟砂之上忍叶鬼保持联络，开始音忍、砂忍联手攻打木叶隐村的准备。大蛇丸曾警告他不要做出违背目的的事，否则会杀死他（但后来戏说只是笑话），但他看着大蛇丸的未来容器──拥有写轮眼的[[宇智波佐助]]就想到了自己，“太过优秀其实是很悲哀的”，因为这个想法，他趁佐助在医院休息（因中了大蛇丸天之咒印而不适）时，打败旗木卡卡西派来看守病房的四名暗部忍者，打算刺杀佐助，之后他似乎想用刀刺在佐助身上，但其实他是把刀抛向早已来到病房的旗木卡卡西。没想到站在那里的“兜”其实是他以死魂之术令其中一位已故暗部忍者暂时复活并变成自己制造假像，而自己则变身成暗部倒在地上，到适当时机便跳窗而逃，卡卡西亦表示面对兜未必能击倒他。

在第三场正式考试开始时，化装成暗部并出现于会场。他医治了当时身有内伤的日向雏田，但被犬冢牙的忍犬赤丸识破了身份，因此立即把牙及赤丸击晕。及后当大蛇丸开始行动时，他便以幻术·涅盘精舍之术使会场所有人陷入深沉的睡眠，然后跟观众席内隐藏的音忍及砂忍一起行动。他的身份亦很快被[[旗木卡卡西]]揭穿，当大蛇丸的行动失败、双手被三代目火影废去后，兜跟砂隐村的叶鬼一同离去。<ref>[http://ask.zol.com.cn/x/5955088.html 求《火影忍者》里药师兜的详细身世]，ZOL问答，2020-6-4</ref>

木叶隐村之战后，砂隐村亦向木叶隐村投降。此时大蛇丸的双手被三代的尸鬼封尽废去，不但要面对难以忍受的痛楚，而且也使不出忍术。作为大蛇丸身边的心腹及医疗忍者，他特制各种药物，但只能稍减大蛇丸的痛楚。最后决定一起前往寻找“传说三忍”之一、拥有高超医疗忍术的纲手，让她治疗大蛇丸的双手。后来他们在短册街的城堡处找到了纲手。大蛇丸向纲手提出条件，只要她肯答应医治，就可以把她重要的人──断及绳树进行复活，以及不会摧毁木叶隐村为条件。纲手尽管很想见到亲人，但她知道大蛇丸是不会轻易放过摧毁木叶隐村的机会，便假装肯医治大蛇丸，然后对他施以偷袭。兜看出[[纲手]]的偷袭，立即掷出手里剑分开大蛇丸及纲手。纲手跟大蛇丸、药师兜之战瞬间展开。

尽管如此，以鸣人的强硬性格，依旧站在纲手面前保护她。鸣人约定要赢得纲手身上的项链、成为火影，奇迹般地接下了兜的致命攻击，并以刚学会的螺旋丸一击重创兜，伤及其内脏，连兜的医疗忍术也无法自愈。但兜在与鸣人接触的一瞬间，已用查克拉手术刀把鸣人的心肌切断，使鸣人在攻击后亦体力不支倒地。兜以为鸣人死定了，纲手为鸣人流的眼泪，使她的精神亦被唤醒了、对血已不再害怕，并为鸣人赌上性命，利用创造再生自愈、又召唤出通灵兽[[蛞蝓]]。自来也赶紧召唤出蛞蟆文太。兜见状立即协助大蛇丸召唤通灵兽──万蛇。经过一场混战后，大蛇丸及万蛇均被纲手、[[自来也]]联手击败。兜立即救醒大蛇丸，并与大蛇丸一同撤退。

自三忍一战结束后，兜正式退居幕后，在大蛇丸身边服侍及为其医疗。因为大蛇丸双手的痛楚日增，所以在宇智波佐助还未来到音隐村前，决定为大蛇丸挑选容器。他从牢中释放了许多被囚禁的忍者，以放胜利者离开为理由，让他们自相残杀，最后只剩下一名忍者──幻幽丸。幻幽丸答应奉献自己给大蛇丸作容器，以换取释放其他被囚禁的伙伴，终亦成为大蛇丸的新容器。

面对大蛇丸，鸣人无比的愤怒使他现出了其中三尾，兜见状欲对鸣人施以偷袭，然而单凭鸣人强大的查克拉，已把兜打飞。不过兜的伤并不重，只消一刻时间便自我治愈了，亦了解到真正的蝎是不会再来，因为已经被眼前的这些人干掉了。他在一旁目睹进化成四尾的鸣人，跟拥有不死身的大蛇丸对战，并称这是“怪物之间的战斗”。经过一番激战，大蛇丸体力不支而退；而兜在救治被四尾鸣人所伤的小樱后（声称是留下他们的性命，让他们干掉更多“晓”的成员），便前往照顾大蛇丸。

三年期限已到，大蛇丸的容器面临极限，兜加紧为大蛇丸配制各种药物。却不知佐助就在大蛇丸处于虚弱时，破了其不尸转生之术，杀死大蛇丸并夺去其一切力量。当佐助从大蛇丸房间走出来的一刻，兜明白到经过他面前的已经不是大蛇丸，而是实力比大蛇丸更强的佐助。对从小当过不同国家的间谍、无家可归的兜来说，感觉再次失去人生目标及身份。然而他想起了鸣人既然能借由超越自身的力量、找到自己的真正身份，自己同样也可以做到。于是他便把大蛇丸的白鳞大蛇躯壳移植到自己的左半身，意图得到大蛇丸的力量，甚至超越他。但他却不擅于操控从大蛇丸移植过来的白鳞大蛇躯壳，因此却反给大蛇丸慢慢侵蚀。此外他也私下跟正追踪佐助的鸣人、雏田和大和会面，把详细介绍“晓”成员的资料本送给鸣人，以作为鸣人令自己有所“领悟”、及重新寻找身份的“礼物”。鸣人他们欲逮捕兜回木叶，但兜却以替身术避开，并且表示只要他能熟练运用大蛇丸的力量，便会和鸣人一战。但他表示要先对付佐助，鸣人想问兜要对佐助做什么，但他却消失在众人面前。<ref>[https://b.faloo.com/p/688685/66.html 木叶见解 前后反差最大的反派]，飞卢小说网，2020-6-4</ref>

之后的修炼中，兜完全掌控了与大蛇丸相同的力量，身躯已经和蛇的形态融为一体，以至于外貌与大蛇丸极为相像。他在泷隐村杀人取尸体后和带土对峙时，自称已经超越第二代火影和大蛇丸，将[[宇智波鼬]]、蝎、迪达拉、角都和长门以秽土转生形式复活，并且以提供带土目前缺乏的战力来换取佐助交涉条件，对带土提议携手合作。带土本来因他以佐助为目标而想拒绝他。但兜在黑绝的帮助下找到了宇智波斑的尸体并秽土转生，最后带土被迫同意。交换条件是战争结果出炉前不能与佐助碰面，以及必须接受带土的监视。由于兜对转生者的束缚力不够，于是绑架前来侦查的御手洗红豆，并吸收她身上咒印的大蛇丸查克拉以强化控制力。<ref>[http://youxi.china.com/news/51716.html 《火影忍者》手游药师兜「半蛇斗篷」3月13日正式登场]，中华网，2020-6-4</ref>

兜最终重拾自我，终于脱离伊邪那美，以龙地洞仙人模式的状态出现在战场，在第二代火影的灵魂禁锢术的帮助下，兜使用医疗忍术抢救佐助，让佐助能够再战宇智波斑。斑开启无限月读以后，兜连同其他人一起中了此术并被神树缠绕。最终第七班结束了第四次忍界大战，无限月读被解除，包括兜在内的所有人终于重获自由。

由于兜已醒悟，并且曾在第四次忍界大战中抢救佐助，间接带来忍界大战的胜利，所以不用再被列入叛忍名单中。兜与儿时的伙伴乌鲁西一同在木叶开设了孤儿院，并担任院长，重兴当年养母的旧业。鸣人等人返回木叶后，将带回的一众[[克隆人]]“宇智波信”托付给了兜。<ref>[http://www.wenjutv.com/question/6132 药师兜的最后结局]，问剧，2020-6-4</ref>

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