据参与科考探险的寻龙山风景区工程师唐俊介绍，主洞和三个出洞有了结果，并不等于对卧龙洞有了全面了解。除主洞外，尚未完全掌握的还有许多岔洞，而纵横交错的岔洞又分上中下三层。基本探明20个洞子，其中一部分已经用于应急通道，一部分用于风景区，如主洞的“大小月城”“蓬莱仙境”“探险奇观”等都有洞子，这些洞子大部分相通。为了探明洞与洞的走向，他们曾多次进洞探险。1996年7月，他和5个勘测队员在卧龙洞“蓬莱仙境”附近发现一个较为隐蔽的岔洞，6人都带了矿灯进洞。洞内有的地方有几间房子那么大的空间，有的地方窄得只有几十公分空间，人要侧身，躺在地上才能进去。在洞里前进了500多米，就用了三个多小时，矿灯也熄了四盏，他们不敢再贸然前进。科考探险2004年11月耗时7天，主要探明了约3600米长的主洞并对还未开发、不被人所知的约250米岔洞进行了较为系统的科学考察。据重庆奥特多探险队工程师王勇介绍，他们走遍大半个中国，探测了很多地下溶洞，地下暗河，但还没遇到过像卧龙洞这么大规模的溶洞。据了解，卧龙洞最早开发是1986年，从前山进洞只开发了680米，也是风景区卧龙洞的第一层，同年又试图从后山菩萨岩洞进入，但在天坑底部的洞口只旋转开发了约20米深，就遇到了30多米深的竖洞，因工程巨大，又无人敢冒险下洞，工程只好停工。第二次开发是1995年11月，当时组织进洞探险测量的还有几个对洞穴很有研究的西藏干部，在洞内测量长达8个多月，于1996年9月动工，前后花了近两年时间，才又开发了2720米，总计3400米。央视《异想天开》栏目组科考探险之后，寻龙山风景区又投入数百万元，对卧龙洞进行了长达两年多的探险、开发，才形成了规模，但对神秘莫测、纵横交错的岔洞仍然没有全面掌握，洞到底有多深仍然未解。

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