* 他一方面继续研究经学史，出版了《群经概论》《孔子》《汉学师承记选注》等；另一方面，为编写教材花了大量心血，如编写了《本国史》《国文教科书》。此外，撰写了《中国现代教育史》。* 从抗战爆发到上海解放这段战乱的年代里，在日寇铁蹄蹂躏下的上海，他身陷“孤岛”，正气浩然，宁肯挨饿，决不到日伪办的学校教书。抗战胜利后，新的内战又起，1946年，在中国共产党的领导下，他与[[张志让]]、[[蔡尚思]]、[[沈体兰]]等发动组织上海大学教授联谊会（“大教联”）。解放前夕，复旦进步学生遭毒打，周谷城曾起草宣言，揭露真相，他与[[陈望道]]、[[洪深]]、[[曹亨闻]]、[[朱伯康]]等著名人士均签了名。坚定地站在民主运动的前列，为保障人民权利与民族解放而奋斗。* 繁忙的社会活动中，他仍坚持教学与科研工作。从1959年起，他恢复了经学史的系统研究，开设全国独一无二的课程“中国经学史”，并悉心培养学生，指导学生和二届研究生撰写专题论文。六十年代初，他和汤志钧合撰了七篇论文，推动了全国学术界重视经学史的研究。此外，他还主编了文科教材《中国历史文选》和《辞海》经学史全部条目。周予同的学术研究贯穿着实事求是的原则，敢于公开抵制极“左”的观点。