温州市港航管理局是由原温州港务管理局和温州航运管理处两个县级单位合并组建的市政府直属正县级事业单位。从2004年11月1日起正式对外办公，履行《中华人民共和国港口法》、《中华人民共和国船舶和海上设施检验条例》所赋予的职能。并受温州市交通局委托，承担辖区内的水运、航道行政管理职能 <ref>[https://news.sina.com.cn/c/2005-10-19/00007208511s.shtml 温州市港航管理局昨揭牌]，新浪网，2005-10-19</ref> 。

十三、承办温州市政府交办的其他事项 <ref>[http://wzjt.wenzhou.gov.cn/art/2019/10/16/art_1692207_38896244.html 温州市港航管理中心简介]，温州市交通运输局，2019-10-16</ref> 。