为了方便学生就近读书，1963年迁到现址重建，有砖木结构平房6幢，建筑面积约2400平方米，校园用地面积为2230平方米。八十年代中后期，学校建设有了较大的变化，校园用地面积增加到14800平方米，新建一幢实验楼和两幢教学楼。随着[[教学]]形势的发展，学校的办学条件与上级要求差距越来越大，在1996年的初级中学评估中，被评为办学条件、学校管理、教育质量薄弱学校。为摘掉薄弱学校的帽子，在区、镇各级政府和教育部门的重视支持下及校友们的殷切关怀下，1997年，得到区政府的扶持，投入1300多万元，对学校进行了全面的改造。近两年来，得到了镇委镇政府的大力支持，投入了近200万元完善学校的设施设备，2005年4月被评为[[番禺区]]一级学校 <ref>[http://xuexiao.51sxue.com/content/id_55404.html 广州市南沙区万顷沙中学学校简介]，我要搜学网</ref> 。

教学楼、实验楼、教师宿舍楼、学生宿舍楼、师生食堂、体育馆分布有序；实验室、图书室、阅览室、电脑室、语音室、电教室、劳技室、历史室、音乐室、美术室、[[生物园]]、地理园、体育馆、[[运动场]]等各类场室一应俱全。拥有22个教学班，学生1282人，教职工69人。学校校风严谨，教学质量稳步提高，成为沙田地区有较大影响的初级中学之一 <ref>[http://gz.bendibao.com/life/202064/267165.shtml 2020广州南沙万顷沙中学(北校区)招生地段]，本地宝</ref> 。