进入小肠中的乳制品中的乳糖，不能被分解，会在肠道定植细菌的作用下产生气体，导致腹胀；产生的酸性物质会导致腹痛；同时，未消化的乳糖和发酵产物会使大肠内渗透压升高，流入肠道内的水量会增加，导致腹泻。这就是乳糖不耐受的症状：腹胀、腹痛和腹泻。乳糖不耐受，严重影响婴幼儿吸收母乳中的乳糖及其他营养物质。<ref>[https://www.360kuai.com/pc/9b33670b5337f5662?cota=3&kuai_so=1&sign=360_57c3bbd1&refer_scene=so_1 乳糖不耐症不用愁！牛奶、奶油、酸奶、冰淇淋都有替代食物 快资讯网 谈古杂谈2019-08-27 08:18]</ref>

[[File:乳糖耐受与不耐受.jpg|缩略图|乳糖耐受与不耐受[http://spider.nosdn.127.net/389d10c83679e121704d2dad4ed9a859.jpeg 原图连接][http://jiankang.163.com/18/1024/10/DUSIQPFC00388050.html 图片来源于]]]

* 任何原因引起的腹泻，都容易损伤宝宝小肠上皮微绒毛，导致继发性乳糖酶的缺乏。此外，婴儿在接受了大剂量头胞类抗菌素治疗后也会引起继发性乳糖不耐受。这是因为抗生素破坏了消化道的内膜，使之在几天或数周内无法正常生成足够的乳糖酶。