1945年8月，二次大戰結束，那年10月，馬廷英教授與東北帝國大學校友陳建功、蘇步青兩位理學博士，同樣留日的蔡邦華、陸志鴻與國民政府特派員羅宗洛共六位教授到台灣，與當時台籍京都帝大醫學博士杜聰明、民報社長林茂生（二二八受難者）一同接收台北帝國大學，將台北帝國大學改名為國立台灣大學 。接收當時，馬廷英教授排除眾議要留用日本學者繼續在台大任教，留用學者植物病理學家松本巍教授與足立仁教授是好友，不但照顧足立仁教授公子足立元彥，也引介馬廷英教授入住足立住宅，馬廷英教授非常珍惜愛護這個地方，沒有受到改建與破壞 。

接收當時，馬廷英教授排除眾議要留用日本學者繼續在台大任教，留用學者植物病理學家松本巍教授與足立仁教授是好友，不但照顧足立仁教授公子足立元彥，也引介馬廷英教授入住足立住宅，馬廷英教授非常珍惜愛護這個地方，沒有受到改建與破壞。  1947年，南京中央大學剛畢業的齊邦媛應馬廷英教授邀請，從上海來台任台大外文系助教，曾經短暫居住在子供房（小孩房）。齊邦媛還記得馬廷英教授特別囑咐，若有男士來訪，她房間門千萬不可關上。齊邦媛是齊世英女兒，馬廷英教授與齊世英同是東北遼寧好友。1960年，齊世英與雷震、高玉樹等人，共同籌組新的反對黨「中國民主黨」，而《自由中國》雜誌也被鎮壓，有些含有社會主義反動思想的書籍，存放到馬廷英教授住的地方 。  1947 。1947 年，馬廷英教授的兩個兒女從大陸來台，兒子就是知名作家馬國光（亮軒）先生，畢業於美國紐約市立大學廣電傳播碩士，曾任教輔大、世新、東海等校教授。