<p style="text-indent:2em;">'''成化十年'''，廷议设总制府于固原，举定西侯蒋琬为总兵官，王越提督军务，控制延绥、宁夏、甘肃三边，总兵、巡抚均听从其节制。后下诏罢免蒋琬，以王越代任，至此三边设总制。后论功加封为太子少保。当时纪功郎中张谨、兵科给事中郭镗等弹劾其滥杀冒功，王越方自以功大赏薄，遂怏怏，称疾还朝。次年与左都御史李宾同掌都察院事，兼督十二团营。[6]汪直掌管西厂用事，与王越结交。王越在朝廷上遇到大学士刘吉、刘珝，称“汪直行事亦甚公。如黄赐专权纳赂，非直不能去。商、万在事久，是非多有所忌惮。二公入阁几日，何亦为此？”刘珝则答道“吾辈所言，非为身谋。使值行事皆公，朝廷置公卿大夫何为？”王越不能回答[7]。

<p style="text-indent:2em;">兵部尚书项忠罢免，王越应当升迁，但朝廷却授予陕西巡抚余子俊，王越感到不平，请解营务，优诏不许，御史自陈屡次战功，被以前兵部尚书白圭压下，乞求加官行赏。余子俊亦称王越赏不酬功，于是王越进兵部尚书，仍掌都察院事，加太子太保，封威宁伯。[8]明年，寇犯延绥，王越调兵援助，颇有斩获，后因调兵与汪直结怨。次年，下诏夺爵除名，谪居安陆，三子以功荫得官者，皆削籍。弘治七年，尚书讼冤，诏复左都御史，致仕。给事中季源、御史王一言交章论[9]。弘治十年，达延汗寇犯甘肃，廷议复设总制官，先后会举七人。吏部尚书屠滽举荐王越，于是王越恢复原职，加封太子太保，总制甘、凉边务兼巡抚。王越言甘镇兵弱，非用延、宁两镇兵难以克敌，后请兼制两镇。次年分兵进攻获胜。后加少保，兼太子太傅。之后朝廷制置哈密事宜。恰逢李广得罪死，后连坐至王越。王越闻忧恨，同年冬卒于甘州。赠太傅，谥襄敏[10]。