清道光15年(西元1835年)加建大南門、小南門、小東門、大北門、小北門等五座甕城，並依其城門的方位命名，小東門又稱<[[鎮東門]]>。 清同治元年(西元1862年)與清同治十三年(西元1874年)，臺灣發生了大地震與暴風雨，土造城垣因禁不住[[風雨]]和[[地震]]的[[摧殘]]，損毀嚴重，經過搶修，得以完固。 乙未戰爭以後，因都市發展的需要，城垣被迫 [[ 拆毀 ]] 。日本大正四年(西元1915年)，小東門及其旁側的城垣難逃拆除的厄運。僅存在勝利路上，北起小東路長約二百公尺，南止於大學路長約六十五公尺的城垣殘段隱藏在樹林下。民國五十五年(西元1966年)，成功大學收購光復營區為校地時，建造校園圍牆，拆除南段城垣。