除了将自然界系统地分为动物界、植物界和矿物界外，《自然系统》还为二名法的创立奠定了基础，而二名法现被用于[[学名]]命名。他1753年出版的《[[植物种志]]》和1758年出版的《自然系统》第10版被认为是命名法的发端。作为命名动植物的先驱，他提供的学名后来都优先采用。唯一的例外是1757年[[卡尔•亚历山大•克莱克]]出版的《[[瑞典蜘蛛]]》，该书中的命名优先于林奈的命名。他的天才吸引了许多年轻学生慕名而来，林奈 <ref>[http://blog.sina.com.cn/s/blog_ec9c13bc0102yeux.html （转载）生物学分类命名的奠基人——卡尔•冯•林奈]，新浪博客，2018-06-29 </ref> 将他们送往国外帮助自己收集植物，这使得他的著作比同辈人更加有影响力。