蛇鳗科鱼类身体细长一如陆地上的[[蛇]]，仅尾部稍微侧扁，尾端尖圆。头部较小，呈钝锥状。吻部为尖形，口裂大，后缘达眼的下方或稍后方，[[眼睛]]很小。前鼻孔多呈短管状有瓣膜，位于上唇边缘或吻端的腹面，后[[鼻孔]]则位于上唇边缘，具舌。鳃孔位于身体中央下方，部分鱼种没有鳃孔。[[牙齿]]为尖锐的锥状或颗粒状 <ref>[http://www.sohu.com/a/232293099_102883 这个史前鲨鱼长了蛇头鳗鱼身，还长着惊悚的300颗”獠牙“] 搜狐，2018-05-21</ref> ，排列方式多样。[[背鳍]]与[[臀鳍]]多半没有被覆厚皮，且并不相连，少数鱼种有但不明显；[[胸鳍]]或有或无，通常没有[[尾鳍]]，或尾鳍不明显。