民国8年（1919年）4月，林葆怿同广东督军领衔发出了“军人不干政”通电，促进了[[护法运动|南北议和]]。同年7月，林葆怿和[[北京政府]]海军部代表协商海军统一，但会谈未能取得成果。<ref name=fzsz/>
[[File:林葆怿3.jpg|缩略图|[https://www.beichengjiu.com/language/175080.html 原图链接]林葆怿]]
民国9年（1920年）12月，北京政府方面派员劝说林葆怿率舰队回到北方，但遭驻[[广州]]的各舰的反对，林葆怿遂弃职出走。