這座寺院是1565年瀾滄國王賽塔提拉由琅勃拉邦遷都萬象時興建,用來供奉從與清邁戰爭中得來的帕佛陀大摩尼寶玉佛。該廟被用作賽塔提拉個人禮拜的地方,正因為如此,在這個寺廟不像老撾其他寺廟一樣有常住僧人。玉佛供奉在寺廟200多年,但在1779年,萬象被拉瑪一世圍攻,寺院被破壞,玉佛被帶走供奉在曼谷至今。
該廟在1816年由國王昭阿努重建,在原供奉玉佛的地方供奉另一佛像,但該寺在1828年因昭阿努起兵反暹羅,和萬象一起被夷為平地。該寺在1936年-42年法國殖民時期第三次重建。在20世紀70年代,玉佛寺從一個禮拜的地方專為博物館,在1993年再轉回寺院。