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邓恋
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个人简介
邓恋，女，青年研究员，博士生导师。2017年获中国科学院大学计算生物学专业博士学位；同年入职中国科学院上海生命科学研究院（后更名为中国科学院上海营养与健康研究所），历任助理研究员、副研究员；2021年9月进入复旦大学生命科学学院，任青年研究员。长期从事群体遗传学和基因组学研究，在Molecular Biology and Evolution, Nature Communications，National Science Review，Nucleic Acids Research，Genome Biology，American Journal of Human Genetics等国际知名期刊发表多篇研究论文，担任国家自然科学基金面上项目和青年项目负责人，并作为课题骨干参与多项国家重点研发计划课题；2019年入选上海市青年科技英才“扬帆计划”；2020年获法国赛诺菲安万特-中科院上海生科院青年科技人才奖；2021年入选中国科学院青年创新促进会会员；现任上海人类学学会“分子人类学”专业委员会常务委员、上海市遗传学会青年委员会委员。
研究方向
群体遗传学/基因组学/计算生物学
1.人群遗传多样性和适应性进化
2.人类表型和疾病的遗传基础和演化历程
代表性论文和论著
[1] Lian Deng, Bo Xie, Yimin Wang, Xiaoxi Zhang, and Shuhua Xu*. 2022. A protocol for applying a population-specific reference genome assembly to population genetics and medical studies. STAR Protocols. 3:101440
[2] Lian Deng#, Yuwen Pan#, Yinan Wang, Hao Chen, Kai Yuan, Sihan Chen, Dongsheng Lu, Siti Shuhada Mokhtar, Thuhairah Abdul Rahman, Boon-Peng Hoh, Shuhua Xu*. 2022. Genetic connections and convergent evolution of tropical indigenous peoples in Asia. Molecular Biology and Evolution. 39(2):msab361
[3] Kai Yuan#, Xumin Ni#, Chang Liu#, Yuwen Pan#, Lian Deng#, Rui Zhang#, Yang Gao, Xuiling Ge, Jiaojiao Liu, Xixian Ma, Haiyi Lou, Taoyang Wu, Shuhua Xu*. 2021. Refining models of archaic–modern human admixture in Eurasia with ArchaicSeeker 2.0. Nature Communications. 12:6232
[4] Lian Deng, Shuhua Xu*. 2021. ‘Chapter 3: Population Genomics of High-Altitude Adaptation’ in Naruya Saitou, Evolution of the Human Genome II: Modern Human Dispersal. Springer, Japan. 67-100
[5] Boon-Peng Hoh#, Xiaoxi Zhang#, Lian Deng#, Kai Yuan, Chee-Wei Yew, Woei-Yuh Saw, Mohammad Zahirul Hoque, Farhang Aghakhanian, Maude E Phipps, Yik-Ying Teo, Vijay Kumar Subbiah*, Shuhua Xu*. 2020. Shared signature of recent positive selection on the TSBP1–BTNL2–HLA-DRA genes in five native populations from North Borneo. Genome Biology and Evolution. doi: 10.1093/gbe/evaa207.