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X射線晶體學
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{| class="wikitable" style="float:right; margin: -10px 0px 10px 20px; text-align:left" |<center>'''结构x射线晶体学分子化学复合冠醚'''<br><img src="https://pic.pngsucai.com/00/30/15/27b07e17eaf05277.jpg" width="250"></center><small>[https://www.pngsucai.com/png/3015485.html 圖片來自PNG素材網]</small> |} '''X射線晶體學'''是一門利用[[X射線]]來研究[[晶體]]中[[原子]]排列的學科。更準確地說,利用[[電子]]對X射線的[[散射]]作用,X射線晶體學可以獲得晶體中[[電子]]密度的分佈情況,再從中分析獲得关于原子位置和化学键的資訊,即[[晶體結構]]。 由于包括[[盐类]]、[[金属]]、[[矿物]]、[[半导体]], 冰,催化剂,吸附剂在内的许多物质都可以形成晶体,X射线晶体学已经是许多学科的基本技术。在前十年这项技术主要被用于测量原子大小、化学键的类型和键长,以及其他的许多物质,尤其是矿物和合金。X射线晶体学也揭示了许多生物分子的结构和功能,例如[[维生素]]、药物、[[蛋白质]]以及[[脱氧核糖核酸]]([[DNA]])。X射线晶体学如今仍然是从原子尺度研究物质结构的主要方法。 == 研究方式 == === 概述(以高分子材料的X射線晶體學为主) === 由於所有的原子都含有電子,並且[[X射線]]的[[波長]]範圍為0.001-10[[納米]],其波長與成鍵原子之間的距離(約數十納米)相當,因此X射線可用于研究各類分子的結構。但是,到目前為止還不能用X射線對單個的分子成像,因為沒有X射線[[透鏡]]可以聚焦X射線,而且X射線對單個分子的[[繞射]]能力非常弱,無法被探測。而晶體(一般為[[單晶]])中含有數量巨大的方位相同的分子,X射線對這些分子的繞射疊加在一起就能夠產生足以被探測的信號。從這個意義上說,晶體就是一個X射線的信號放大器。X射線晶體學將X射線與[[晶體學]]<ref>[https://pansci.asia/archives/tag/%E6%99%B6%E9%AB%94%E5%AD%B8 晶體學],泛科學</ref> 聯繫在一起,從而可以對各類[[晶體結構]]進行研究,特別是[[蛋白質]]晶體結構。 === 获得晶体 === 通过X射线衍射分析结构必须首先获得样品的单晶。晶体生长的方法有很多,如气相扩散法、液相扩散法、温度渐变法、真空升华法、对流法等等,而目前应用最广泛的一种晶体生长方法是气相扩散法。气相扩散法又可以分为悬滴法、坐滴法、三明治法、油滴法和微量透析法。其中,悬滴法的使用频率最高。(以上方法都属于化学方法,通常,研究凝聚态物理的用得最多的是区熔法,以多晶材料为基础通过局部施加高温使其部分熔化后再结晶,从而逐渐得到大块的晶体,高分子材料通常不能承受过高温度,所以无法使用这种方法) 结晶时,生成晶体的溶液须先进入成核状态形成晶核,然后进入稳定态使晶体成长,才能获得足够大小的单晶。而合适的晶体生长条件往往极难预测,所以在获得初步的晶体生长条件后,需要对晶体生长条件进行优化,包括调整沉淀剂浓度(如聚乙二醇、盐类等)、[[pH]]值、样品浓度、[[温度]]、[[离子强度]]等。 === 衍射数据收集 === 在获得单晶之后,就需要进行衍射实验,即用X射线打到晶体上,产生衍射,并记录衍射数据。 由于结晶条件的苛刻和晶体本身的脆弱,操纵晶体时要小心防止将其破坏。有多种方法可用于固定晶体并控制其在衍射实验中的旋转。过去的一种方法是将晶体与母液一同吸入一根毛细玻璃管。如今常用的方法是将晶体置于玻璃或尼龙纤维上,并用液氮冷却X射线带来的能量。 X射线的来源主要有两种,一种是在常用X射线仪上使用的,通过高能电子流轰击[[铜]]靶(或[[鉬]]靶),产生多个特征波长的X射线,其中使用的CuKα的波长为1.5418[[埃格斯特朗 (单位)|Å]];另一种就是利用[[同步辐射]]所产生的X射线,其波长可以变化。同步辐射X射线可以分为角散同步辐射(ADXD)和能散同步辐射(EDXRD)两种,角散同步辐射的实验原理与通常的X射线衍射仪是一样的,不过波长更低(如0.6199[[埃格斯特朗 (单位)|Å]]),能量更高;而能散使用白光入射,即入射光具有连续波长,收集的衍射信号是在固定角度进行的,它的分辩率较角散同步辐射低,技术要求也较低。现在中国的[[北京同步辐射装置]](BSRF)已经升级成了角散的。 衍射数据(包括衍射点的位置和强度)的记录多采用像板或CCD探测器。 === 數據分析 === 對記錄到的繞射數據進行分析,可以獲得晶體所屬的[[晶系]]和對應的[[布拉菲晶格]]以及每個繞射點在[[倒晶格]]上的[[密勒指數]]和對應的強度。 === 晶体结构解析 === 由于晶体衍射图样实际上是晶体中所有原子的电子对X射线衍射的叠加,而现实中并不存在可以聚焦X射线的透镜,通过对衍射结果(用[[结构因子]]来表示)进行反傅立叶变换,才可以获得晶体中电子密度的分布。而[[结构因子]]是与[[波动方程]]相关的,计算结构因子需要获得波动方程中的三个参数,即[[振幅]]、[[频率]]和[[相位]]。振幅可以通过每个衍射点的强度直接计算获得,频率也是已知的,但相位无法从衍射数据中直接获得,因此就产生了晶体结构解析中的“相位问题(phase problem)”。 有几种解决相位问题的方法,其中分子置换法、同晶置换法和反常散射法常用于解析[[生物大分子]]结构。: 直接法:直接计算相位,常用于较小的分子(含有少于1000个氢原子以外的原子)。 == 历史由來 == === 早期结晶和X-射线 === 虽然人们自很久以来就很喜欢漂亮的晶体,但科学化的研究是等到17世纪才开始的。[[约翰内斯·开普勒]]于1611年发现雪花的对称六角结构是由水分子规则性的排列组成。 [[尼古拉斯·斯坦诺]]于1669年研究晶体的对称性,他指出在同一个晶体上面与面的角度总是一样的。于1784年发现,晶体的结构都能被描述成把相同大小形状的物体重复有规则的排列。William Hallowes Miller与1839年给晶体的每一面各标上整数,[[密勒指数]]到现在还被用于确定晶体方向。 [[勒内·茹斯特·阿羽依]]的研究告诉我们晶体的正确概念,晶体是由晶体结构在三个方向上重复排列。 [[威廉·伦琴]]于1895年发现[[X射线]]。物理学家当时不清楚那是什么,怀疑他是[[电磁波]](它的确是)。经许多实验的许多现象说明X射线是电磁波,但X射线同时有粒子的特性(它的确应该有,因为[[电磁波]]的载体是[[光子]]——一种粒子)。[[威廉·亨利·布拉格]]因为这点于1907年认为[[X射线]]不是[[电磁波]]。[[马克斯·冯·劳厄]]于1912年证实[[X射线]]确实是[[电磁波]]。 == 參考文獻 == {{reflist}} [[Category:340 化學總論]]
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